Сіз қаттыны ыстықпен салыстырып тұрсыз. Bootstrap ол бірінші кезекте css/javascript фреймворк, яғни тек front end. Ал yii және kohana ол php фреймворктар, яғни back end. Қысқаша айтқанда, боотстраппен сайттың көрінетін жағын, қалған екеуімен сервер жақты жасайсыз.
Yii2 туралы мына сайтта жақсы материалдар бар. Kohana туралы білмейді екенмін.
