Пайдасы. Бұл өнімдердің пайда болуы, бірінші кезекте ауыл шаруашылығына тиімді әсер етті. Көкөністер мен жемістердің өнімділігін арттыруға мүмкіндік жасалды. Оларды өсіру оңай болғандықтан, нарықтағы бағасы да төмендеді. Сонымен бірге, ГМӨ зиянды жәндіктермен, вирустармен және бактериялармен күресе алады. Гендік модификацияланған тағамдар қатерлі ісікке, бедеулікке немесе демікпеге (астмаға) әкелуі мүмкін деген пікірлерді жиі естуге болады. Алайда, бұл тұжырым қате. Трансгендік өнімдер бірде-бір өлімге, тіпті қарапайым ауруға соқтырған жоқ. Ол фармакологияда да қолданылады, оның негізінде әртүрлі ауруларға қарсы вакциналар шығарылады. Мамандардың болжамы бойынша, 20 жылдай кейін жер шарының тұрғындары 2 миллиардқа көбейеді. Дәл қазір, аштықта өмір сүретін адамдарың саны 700 миллионды құрайды. Трансгендік тағамдарды қолдайтын ғалымдардың айтуынша, ГМӨ адамзатты аштықтан құтқара алады.
Зияны. Экологтардың айтуынша, гендік өзгеріске ұшыраған өсімдіктер қоршаған ортаға залал келтіреді деп санайды. Мәселен, олар зиянды жәндіктерді ғана емес, сонымен қатар, мүлдем зиянсыздарды да жояды. Көптеген табиғи өсімдіктер, бәсекелестікке шыдай алмағандықтан, жойылып кетуі мүмкін. Бұл жағдай – табиғаттың тепе-теңдігін бұзады. Бұл организмдер жақында пайда болғандықтан, қорытынды жасау әлі ерте. Оны қолдануға ресми тыйым салынған жоқ, сондықтан, ГМО-нің болашағы тұтунышылардың қолында.