Қазақстанда діни радикалды топтар, әсіресе ислам атын жамылған экстремистік ұйымдар, ең көп таралған қауіптердің бірі болып саналады. Олардың қатарына "Хизб ут-Тахрир", "Таблиғи Жамағат" (Қазақстанда тыйым салынған), ДАИШ (ИГИЛ) және басқа да ұйымдар кіреді. Бұл ұйымдар радикалды идеологияны таратып, кейбір жағдайларда террорлық актілерге қатысқан.
Алайда, Қазақстанда тек діни емес, басқа да мақсаттағы қауіпті ұйымдар мен топтар болған. Мысалы:
1. Сепаратистік қозғалыстар – кейбір ұлтшыл топтар Қазақстанның кейбір аумақтарын бөліп алу туралы идеяларды алға тартқан. 1990-жылдары және 2010-жылдардың басында Солтүстік Қазақстанда және басқа өңірлерде осындай әрекеттер тіркелген.
2. Экстремистік саяси ұйымдар – кейбір саяси қозғалыстар, әсіресе шетелдік ықпалы бар топтар, тұрақсыздық тудыруға тырысқан.
3. Ұлттық радикалдар – Қазақстанда этносаралық қатынастарды ушықтыруды көздейтін кейбір топтар әрекет етуі мүмкін.
Дегенмен, Қазақстан билігі мұндай ұйымдарды бақылауда ұстап, олардың таралуына қарсы шаралар қабылдап келеді. Елде экстремизмге қарсы заңдар күшейтіліп, тұрақтылықты сақтау мақсатында әртүрлі бағдарламалар жүзеге асырылуда.