Арал теңізінің суы одан ағатын суға қарағанда оған аз келетіндіктен, суы таязданып барады. Мұның негізгі себептері:
Суаруға арналған су шығыны. 1960 жылдары КСРО Орта Азиядағы жерді қарқынды игеруге шешім қабылдады. Ол үшін Арал теңізіне құятын өзендерден алынатын судың көп мөлшері қажет болды. Соның нәтижесінде 1960-1990 жылдар аралығында Амудария мен Сырдария өзендерінің су алуы жылына 50-ден 120 текше шақырымға дейін өсті.
Климаттық өзгеріс. Арал теңізіндегі су деңгейінің төмендеуі климаттың өзгеруімен де байланысты. Соңғы онжылдықтарда Орталық Азияда жауын-шашынның азаюы байқалады, бұл да теңізге құйылатын судың азаюына әкеледі.
Осы факторлардың нәтижесінде соңғы 60 жылда Арал теңізіндегі су деңгейі 20 метрден астам төмендеп, теңіздің ауданы 68,0 мың км²-ден 17,1 мың км²-ге дейін қысқарды. Бұл аймақта күрделі экологиялық проблемаларға әкелді.
Арал теңізінің одан әрі тайыздануын тоқтату үшін Әмудария мен Сырдария өзендерінің су алуын азайту қажет. Қазіргі таңда бұл бағытта жұмыстар жүргізілуде, бірақ ол әлі айтарлықтай нәтиже берген жоқ.
