Неймар родился в семье торговца ювелирными изделиями Неймара Сантоса[7] и Надин Сантос, позже родилась его сестра, Рафаэла[4]. Он воспитанник клуба «Сантос», куда он попал в 1999 году[7]. Уже в самом юном возрасте, ещё даже не дебютировав в основном составе клуба, Неймар привлёк к себе внимание самых разнообразных европейских клубов, включая «Манчестер Сити», «Реал Мадрид», «Арсенал», «Барселону», «Челси» и «Милан»[источник не указан 416 дней], которые с помощью скаутов наблюдали за его игрой в «Копинье», молодёжном первенстве Сан-Паулу, в котором нападающий произвёл фурор, получив прозвище «Новый Робиньо» благодаря манере дриблинга, схожей со знаменитым форвардом. В возрасте 12 лет он даже уехал в академию «Реала», но из-за тоски по родине вернулся в Бразилию[8]. По другой же версии «Сантос», где форвард оказался годом ранее, заплатил семье игрока 1 млн реалов, чтобы тот остался в академии клуба[4]. Прославился Неймар и игрой за сборную до 15 лет на южноамериканском чемпионате.
В 2008 году Неймар подписал свой первый профессиональный контракт с «Сантосом», рассчитанный до 2014 года, с огромной суммой отступных, которые сразу отпугнули многих потенциальных покупателей, 40 % сделки принадлежит компании «Гропо Сонда», правда некоторые клубы не отступились, в частности «Манчестер Юнайтед» и «Реал», но «сливочные» имели приоритетное право на покупку футболиста, поскольку подписал с ним предварительный контракт[9]. 7 марта 2009 года Неймар дебютировал в основном составе «Сантоса» в матче с «Оэсте», заменив Маурисио Молину[10]. Неделю спустя в матче с «Можи-Мирин» форвард забил свой первый мяч в основном составе клуба. 24 марта 2009 года стало известно, что в Неймаре заинтересован и московский ЦСКА[1]. Позже Неймаром вплотную заинтересовался «Милан».